Map ton share sur un drive Windows et dans ton vfs, utilise:
"M:\" /qqchose
Si tu roules io en service, tu devras mapper ton share avec "net use" dans un fichier .bat qui sera executé OnConnect (ou qqchose de similaire dans ioFTPD.ini).
Me semble qu'il y a un article kb qui explique déjà tout ça...
http://www.ioftpd.com/kb